Kararın "olumlu" olduğunu vurgulayan AB Komisyonu, Yüksek Askeri Şura, askeri yargı sistemi ve Türk Silahlı Kuvvetleri Personel Kanunu'nun da değiştirilmesi gerektiğinin altını çizdi. Genişleme Komiseri Stefan Füle'nin sözcüsü Peter Stano tarafından yapılan açıklamada milli güvenlik derslerinin müfredattan çıkarılacak olması "güvenlik kuvvetlerinin sivil denetimi yönünde atılmış olumlu bir adım" şeklinde nitelendirildi. Konunun Komisyon'un yayınladığı 2011 ilerleme raporunda gündeme getirildiğine işaret eden açıklama, mezkur kararın eğitim sisteminin modernleşmesi açısından da "mühim bir adım" olduğuna işaret etti. Ancak AB, asker-sivil ilişkilerinin Avrupa standartlarına getirilmesi için daha fazla reform yapılması gerektiğinin altınız çizdi. Açıklamada, "Bu çerçevede güvenlik kuvvetlerinin sivil denetimine ilişkin adımlar çerçevesinde özellikle Yüksek Askeri Şura'nın yapısı, askeri yargı sistemi ve Türk Silahlı Kuvvetleri Personel Kanunu'nun tadil edilmesi gerektiğini hatırlatırız" denildi.