3. iddianamede yer alan bilgilere göre, Şener Eruygur'un talimatıyla, darbeye zemin hazırlamak için uygulanacak stratejileri geliştirmek ve gerekli materyalleri toplamak için kurulan CÇG, hazırladığı 'Devre Raporları' için Erol Manisalı'nın görüşlerini almış. Erol Manisalı'nın evinde bulunan 'Lobi' kodlu dokümanın 'Politika' başlıklı bölümünde sivil toplum örgütlerinin ulusal çıkarlara uygun tepkisel eylemlerde bulunmasının sağlanması ve kitlesel tepkiler organize edilmesi gerektiği anlatılıyor. İddianamede, "Şüpheli Erol Manisalı görüşleriyle oluşturulduğu anlaşılan Cumhuriyet Çalışma Grubu Devre raporlarından 11 No'lu devre raporunda, 'Genel Konular' başlığı altında Türkiye'de ulusal cephe hareketinin kopuk olduğunu, bütün çabanın bunların birbiri ile ilişkilendirilmesi üzerine yoğunlaşılması gerektiğini belirtmiş. Yine şüpheliden ele geçirilen dokümanda, 'Neden bu örgütlenmeler birlikte bu esas mesele niçin bir araya gelip bir platform oluşturmuyorlar? Birlik güçtür, bir araya gelmelerini engelleyen nedir?' ibarelerinin yer aldığı dokümandan da anlaşılacağı üzere, şüphelinin, sivil toplum kuruluşlarının etki altına aldıkları insanları da kendi amaçları etrafında yönlendirerek, yürütme organını devirmeye teşebbüs eylemleri için kışkırtmak suretiyle bu fiillere iştirak ettiği (tespit edilmiştir)." İKTİDARA ALTERNATİF ÇALIŞMALARI İddianamede, Manisalı'nın 'CÇG Devre Raporları'nda belirtildiği gibi 'Ergenekon'un amaçları doğrultusunda sözde ulusalcı yapılanmaları bir araya getirerek tek seslilik sağlanması ve ortak hareket edilerek muhtemel bir darbe sonrası yürütme organı yerine yeni bir iktidarın meydana getirilebilmesi için şimdiden bir iktidar alternatifi ortaya çıkarma faaliyetleri içerisinde bulunduğu'' değerlendirmesi yer aldı.