KOÜ'de görev yapan Yrd. Doç. Dr. Mustafa Çakır, yurtdışındaki bir kongreye katılmasına izin verilmediğini ve "psikolojik baskıya" maruz kaldığını öne sürerek, 2009 yılının Aralık ayında Balkır hakkında Kocaeli 4. Sulh Mahkemesi'nde maddi ve manevi tazminat davası açtı. Çakır, dava dilekçesinde idare tarafından sürekli ve planlı bir şekilde kendisine mobbing uygulandığını, bunun sonucunda da akademik çalışma yapamaz hale geldiğini belirtti. Davayı, 14 Temmuz'daki 8'inci celsede karara bağlayan mahkemenin hâkimi Yurdanur Balkan, Dekan Balkır'ı 3 bin lira manevi tazminata mahkûm etti. Çakır'ın avukatı Murat Çakır, mobbing davalarının özellikle Avrupa Birliği (AB) ülkelerinde çok yaygın uygulandığını ve Türkiye'dekine oranla çok daha ağır cezaların verildiğini söyledi. Çakır, "Bu dava, bence Türkiye'de birçok kişiye emsal olacak. Biliyorum ki özellikle kamu kuruluşlarında birçok kişi bu baskıya maruz kalıyor ancak böyle bir hakkı olduğunu çoğu insan bilmiyor. Kazandığımız bu davadan sonra birçok kişinin mobbing davası açacağını düşünüyorum." diye konuştu.