Kısa süre önce tedavi için başkentteki Gülhane Askeri Tıp Akademisi'ne (GATA) giden Özkök'ü, akademi komutanı, yardımcısı, bölüm başkanı değil, sadece bir asteğmen karşıladı. Özkök, tedavisini yaptırarak hastaneden ayrıldı. Genelkurmay'ın düzenlediği birçok etkinlikte yer almayan Özkök, son olarak İstanbul'da Harp Akademileri'ndeki sempozyumda da yoktu. Özkök dışındaki birçok eski genelkurmay başkanı emekli komutan sempozyumda hazır bulundu. Özkök'ün etkinliklere davet edilip edilmediği resmen açıklanmadı. Özkök'ün orduyla ilişkilerinin zayıfladığını gösteren son örnek, kısa süre önce GATA'da yaşandı. Tedavi için hastaneye giden eski Genelkurmay Başkanı'nı, GATA Komutanı'nın karşılaması gerekiyordu. Ancak, ne GATA Komutanı, ne yardımcısı, ne tedavi göreceği radyoloji bölümü başkanı, ne de "general" rütbesinde bir subay karşıladı Özkök'ü. Eski Genelkurmay Başkanı, bir asteğmen tarafından karşılandı ve uğurlandı. Türk Silahlı Kuvvetleri'nin yeniden yapılandırılan internet sitesinde de, Özkök'ün biyografisinde değişikliğe gidilmedi. Özkök'ün biyografisinde bütün eski genelkurmay başkanlarından farklı olarak, görevde bulunduğu süreden itibaren "Türkiye Cumhuriyeti Anayasası'na göre, Başbakan'a karşı sorumlu olan Orgeneral Özkök, barış zamanında Türk Silahlı Kuvvetleri Komutanı, savaş zamanında ise Cumhurbaşkanı'nı temsilen, Türk Silahlı Kuvvetleri Başkomutanı olarak görev yapar" ifadesi yer alıyordu. Genelkurmay'ın yenilenen sitesinde bu ifade olduğu gibi korundu. CNNTürk imzalı habere ANKA isimli ajanstan yalanlama geldi. Habere göre emekli Orgeneral Hilmi Özkök, GATA'da bir asteğmen tarafından değil, tam tersine protokolden sorumlu bir tümgeneral tarafından karşılandı ve uğurlandı. Emekli Orgeneral Özkök'ün GATA'ya son olarak 26 Mart 2007 tarihinde geldiğini vurgulayan yetkililer, 'Komutanımızı veya yakınlarını incitici herhangi bir tavır içinde olunması düşünülemez' yorumunu yaptı.