Danıştay saldırısı ve Cumhuriyet Gazetesi'ne bombanın Ergenekon ile bağlantılı olduğunun ifade edildiği İddianamede Başbakan Erdoğan ve Genel Kurmay Başkanı Yaşar Büyükanıt'ın ismi de suikast planları arasında geçiyor. İddianamede Danıştay saldırısı ve YÖK eski Başkanı Erdoğan Teziç'e saldırının benzerlik gösterdiğine de dikkat çekiliyor. Danıştay saldırısını gerçekleştiren Alpaslan Aslan ile Muzaffer Tekin ile bağlantısının olduğu iddiası da yer alıyor. Ayrıca Cumhuriyet Gazetesi'ne saldırının Muzaffer Tekin'in talimatı ile gerçekleştiği de kaydediliyor. Yargıtay Başkanlığı'nda üst düzey yöneticiye suikast hazırlığı, Nato tesislerine saldırı hazırlığı, DTP'li yöneticilere saldırı hazırlığı da iddianamede yer alan eylem planları arasında. İddianamede yer alan bilgilere göre, TİT Başbakan'a suikast planlıyordu. Suikast planlanan diğer isimler: Orhan Pamuk, Osman Baydemir, Ahmet Türk, Sebahat Tuncel, Fehmi Koru...