30
Mart 2008 tarihinde
Cumhuriyet gazetesine yönelik
molotoflu saldırıyla ilgili 6'sı
tutuklu 8
sanık hakkında
dava açılmıştı. Davaya
İstanbul 12. Ağır
Ceza Mahkemesi bakıyordu. Mahkeme dosyanın
Ergenekon ana davasıyla birleştirilmesini talep etti. Ancak ana davaya
bakan İstanbul 13.
Ağır Ceza Mahkemesi bu talebi reddetti.
Ergenekon davasına bakan
mahkemenin red kararı, olayların bağlantılı olmadığı gerekçesine dayanmıyordu. Aksine Cumhuriyet'e saldırının Ergenekon bağlantısı teyit ediliyor, ancak iş yüküne dikkat çekilerek davaların birleştirilmesine karşı çıkılıyordu.
İki mahkeme arasında yaşanan uyuşmazlık sebebiyle 10 klasörden oluşan Cumhuriyet gazetesine
molotoflu saldırı davasının dosyası ile 750 klasör ve 10 DVD'den oluşan Ergenekon dava dosyaları
Yargıtay'a gitti. Yargıtay savcısı da "Dosyalar birleştirilmesin" dedi. Ancak Yargıtay 5. Ceza Dairesi 13
Nisan 2011'de oy birliği ile davanın Ergenekon ana davasına dahil edilmesine karar verdi.
Davaların birleştirilmesinin ardından molotof davası sanıkları da ilk kez Ergenekon Davasının görüldüğü Silivri'de hakim karşısına çıktı.