Tutuklu sanıklardan emekli Binbaşı Mehmet Zekeriya Öztürk'e ait bir ajandada, el yazısıyla, "YSK üyeleri nasıl seçiliyor, kim bunlar, ekonomik ihtiyaçları, yetenek ve siyasi durumları. Eski Yargıtay üyeleri ile konuşulabilir." notu bulunduğu tespit edildi. Ajandadaki notun sahibi Zekeriya Öztürk'ün, 22 Temmuz seçimleri sonrası yaptığı bir telefon konuşmasında da seçim sonuçlarına yönelik tepkisi görülüyor. Cezaevinde evlendiği gazeteci Gülay Kömürcü ile yaptığı görüşmede, artık Türkiye'de yaşamak istemediklerini söylüyorlar. Öztürk, vatandaşlıktan çıkmak için dilekçesini hazırladığını ifade ederken Kömürcü, "Burada yaşayabilir miyiz artık? Ben Türkiye'ye aitlik duygumu kaybettim." diyordu. Bir başka tutuklu sanık Ümit Sayın, hem YSK'yı suçluyor hem de millete hakaret ediyordu. İddianameye yansıyan 12 Ocak 2008 tarihli telefon konuşmasında, "22 Temmuz'dan umutluyduk, orada da büyük bir üçkâğıt yaptılar. YSK satın alındı, yani neye güveneceksiniz, nasıl seçim yapacaksınız ki bu ülkede yani? Ee. Hepsi bunların darbe nedeni." diyordu. Ergenekon'un seçimlere müdahale ettiği iddiası, 2004 yerel seçimlerinde gündeme gelmişti. Samsun, Mersin ve Eskişehir'deki seçimlerde örgütün parmağı olduğuna dair bazı kuşkular dile getirilirken bir de belge ortaya çıkmıştı. YSK, son dönemde yerel seçimlerde oy kullanmak için kimlik numarası şartı ve başörtülülerin sandık görevlisi olamayacağına dair kararlarıyla tartışmaların odağında.