Ergenekon soruşturması kapsamında tutuklanan ve Genelkurmay Başkanlığı tarafından varlığı hiçbir zaman kabul edilmeyen JİTEM'in kurucusu olarak gösterilen emekli Albay Arif Doğan'ın mahkemede JİTEM'le ilgili bazı bilgiler verdiği öğrenildi. Milliyet gazetesinin haberine göre Doğan, 15 Ağustos 2008'de Ankara 11. Ağır Ceza Mahkemesi'ne verdiği ifadede şunları söyledi: "Ben Jandarma İstihbarat Grup Komutanlığı ve JİTEM Grup Komutanlığı görevlerinde bulundum. Jandarma İstihbarat Grup Komutanlığı, kadrosu Genelkurmay'ca tasdikli olunan bir görevdir. JİTEM ise yine üst düzey, daha doğrusu yetkili komutanların bilgisi ve kararları doğrultusunda denenmek üzere kurulmuş bir yapılanmadır. Ben de bunun kurucusuyum. Faaliyet alanı OHAL bölgesidir. Dışına taşması söz konusu değildir ve kadrolu elemanları yoktur. Denenme sürecinde olduğu için biz mesailerimizden ve mesai sonrası saatlerimizden zaman ayırmak suretiyle, yasalara uygun olarak terörle mücadele ettik." 'Ersever yardımcımdı' Doğan'ın ifadesi şöyle devam ediyor: "Üst düzey görevlerim sırasında pek çok belge elime geçmiştir. Belgeleri sakladım. Görevim çerçevesinde uyuşturucu ile de mücadele ettik. Operasyonlarda 'yem' olmak için uyuşturucu kullandık. Depodaki uyuşturucu da bu amaçla kullanılmıştır. Bence bozulmuş ve niteliği kaybolmuştur. İstanbul Çavuşbaşı'nda bulunan depodaki malzemeler genel olarak bana aittir. Bir kısmı yakın çalışma arkadaşlarımındı. Bu depoyu 1 yıldır kullanıyorum. Cem Ersever benim yardımcımdı. Benim sandıklarımı ortak kullanırdık. Bulunan mermiler çok gözükse de benimle ilgisi yoktur. Ersever'in mermiye adeta hobisi vardı. Benim ve arkadaşların istihkaklarımızı da istediği olurdu. Kendisini sevdiğimiz, hobisini bildiğimiz için verirdik. Bulunan mermilerin Cem'e ait olduğundan eminim. Bulunan uçaksavar mermiler ise imha edilecek türdendir. Patlama özelliği yoktur. Bunların bir kısmını üst düzey bürokratlara masa süsü olarak isimlerini yazmak suretiyle hediye ederdim."