Cinayet soruşturması hemen başladı. Ancak herhangi bir sonuca ulaşmadı. Hatta 5 yılda 3 savcı değişti, soruşturma davaya dönüşmedi. Cinayet soruşturmasının devam ettiği dönemde Ergenekon kapsamında çok önemli ifadeler ve teknik takip kayıtları çıktı ortaya. Bir süre tutuklu kalan Ergenekon sanığı Erol Ölmez, cinayetin perde gerisini aydınlatacak ifadeler verdi. Erol Ölmez, iddia edilen Ergenekon terör örgütünün hedefleri doğrultusunda cemaate sızmakla suçlanıyordu. Zira Ölmez yasal takiple elde edilen dinlemelerde, cemaate sızdığını anlatıyordu. Bunu ifadelerinde de itiraf etti. Bayram Ali Öztürk cinayetinde Ergenekon bağlantısı şüphesini uyandıran başka veriler de vardı. Örneğin cinayet günü bazı Ergenekon sanıklarına ait telefonların İsmailağa ve çevresinden sinyal verdiği de tespit edildi. Yeni Akit Gazetesi cinayetin 5. yılında Ergenekon savcılarının dosyaya el attığını yazdı. İddiaya göre İsmailağa Cemaatinin önemli liderlerinden Bayram Ali Öztürk Hoca'nın neden ve kimler tarafından öldürüldüğünü bundan böyle Ergenekon savcıları soruşturacak. Beklenti alınan ifadeler ve ulaşılan bilgiler çerçevesinde 4 yıldır yürütülen soruşturmanın artık davaya dönüşmesi...