Cumhurbaşkanı Abdullah Gül’ün başkanlığında yapılacak MGK’nın ilk gündem maddesi, daha önce 3 Eylül’de müzakereler başlayacağı için Kıbrıs olarak belirlenmişti. Ancak Rusya ile Gürcistan arasındaki savaş nedeniyle gündem sıralaması "1-Kafkasya, 2-Kıbrıs, 3-Irak" oldu. MGK, Kafkasya’daki savaşın yansımalarını kapsamlı şekilde görüşecek. Başbakan Tayyip Erdoğan, Moskova ve Tiflis’e yaptığı ziyaretler, Dışişleri Bakanı Ali Babacan da NATO’daki olağanüstü toplantıyla ilgili kurul üyelerine bilgi verecek. Kafkasya görüşülürken, Ermenistan’la yeni açılım politikası da ele alınacak. Erdoğan, Türkiye’nin yeni politikasıyla ilgili dünkü Bakü ziyaretine ilişkin bilgi verecek. Cumhurbaşkanı Gül’ün 6 Eylül’de milli maç nedeniyle Erivan’a gidip gitmemesi konusunun da MGK’da açılması bekleniyor. 30 Ağustos’tan itibaren emekliye ayrılıp görevini Kara Kuvvetleri Komutanı Orgeneral İlker Başbuğ’a devredecek Genelkurmay Başkanı Orgeneral Yaşar Büyükanıt da, son MGK’sında kurul üyelerine veda edecek.