Cumhurbaşkanı Ahmet Necdet Sezer tarafından 15 üniversiteye yapılan rektör ataması Resmi Gazete'de yayınlanarak yürürlüğe girdi. Manisa Celal Bayar Üniversitesi'ne yapılan atama ise tartışmaları beraberinde getirdi. Çünkü Sezer, 2002'de seçim birincisiyken rektör yapmadığı Semra Öncü'yü, bu seçimde ikinci geldiği halde rektör atadı. Sezer'in iki tercihi arasında büyük çelişki bulunduğuna dikkat çeken Manisalılar, "Semra Öncü'nün adı Sezer'in eşi ile aynı. Atamada bu durum etkili olmuş olabilir." diye espiri yapıyor. Cumhurbaşkanı Sezer, Manisa'da sürpriz yaparak, seçimlerde 270 oy alan Prof. Cemil Özcan'ın yerine 63 oyla ikinci olan Prof. Dr. Semra Öncü'yü getirdi. Öncü'nün atanması ile Celal Bayar Üniversitesi ilk kadın rektörüne kavuşmuş oldu. Celal Bayar'da 2002 yılında yapılan rektörlük seçimlerinde rektör adayı olan Prof. Dr. Semra Öncü, akademisyenlerden 182 oy alırken, diğer aday Prof. Dr. Cemil Özcan, 109 oy alarak ikinci olmuştu. Ancak, Cumhurbaşkanı Ahmet Necdet Sezer'in tercihi, Prof. Dr. Cemil Özcan'dan yana olmuştu. Bu defa tam tersi oldu. Cumhurbaşkanı tercihini, en çok oyu alan Prof. Dr. Cemil Özcan değil, eşiyle aynı adı taşıyan Prof. Dr. Semra Öncü'den yana kullandı.