Belgeler, incelenmesi için TÜBİTAK'a gönderilmişti. TÜBİTAK'ın imzaların gerçek olduğunu belirtmesi üzerine de operasyon başlamış ve 41 kişi tutuklanmıştı. İşte Balyoz soruşturması sürecinde yaşananlar: 20 Ocak: Taraf, dönemin 1. Ordu Komutanı Çetin Doğan imzalı 'Balyoz' darbe planlarını yayımladı. Aynı gün Çetin Doğan, t24'e yaptığı açıklamada, planları kabul etti ancak akşam yalanladı. 21 Ocak: Genelkurmay Başkanlığı'ndan yapılan açıklamada planın 1'inci Ordu Komutanlığı tarafından 5-7 Mart 2003 tarihleri arasında icra edilen plan semineri olduğu savunuldu. 21 Ocak: İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığı, planla ilgili inceleme başlattı. 26 Ocak: İçişleri Bakanı Beşir Atalay, Balyoz'la gündeme gelen EMASYA Protokolü'nün kaldırılması hakkında çalışmaların sürdürüldüğünü söyledi. 26 Ocak: Eski 1. Ordu Komutanı Orgeneral Çetin Doğan, internete düşen ses kaydındaki darbe planının tartışıldığı seminerde yaptığı konuşmanın kendisine ait olduğunu kabul etti. 28 Ocak: 'Balyoz'a ilişkin iddialar kapsamında 'tutuklanacaklar' listesinde adlarının yer aldığı ileri sürülen 27 gazeteci, İstanbul Cumhuriyet Savcılığı'na suç duyurusunda bulundu. 29 Ocak: Taraf Gazetesi muhabiri Mehmet Baransu, 'Balyoz planı'na ait olduğu belirtilen belgelerin asıllarını İstanbul Cumhuriyet Savcılığı'na verdi. 1 Şubat: Belgelerin, incelenmek üzere Adli Tıp Kurumu'na gönderildiği öğrenildi. ASKERî SAVCILIK: bU BİR DARBE PLANIDIR 4 Şubat: Askere toplumsal olaylara müdahale yetkisi veren EMASYA Protokolü yürürlükten kaldırıldı. 22 Şubat: "Balyoz Güvenlik Harekât Planı"nda yer alan ıslak imzalar TÜBİTAK ve Emniyet Kriminal tarafından onaylandı. İmzaların gerçek olduğunun belirlenmesi üzerine eski kuvvet komutanları Özden Örnek, İbrahim Fırtına, Aytaç Yalman ile Ergin Saygun'un savcılıkça ifadesi alındı. 26 şUBAT: Askerî savcılık tarafından oluşturulan bilirkişi heyeti, 'Balyoz' belgelerinin seminer değil darbe planı olduğu sonucuna vardı. 14 Mart: Genelkurmay Başkanı Orgeneral İlker Başbuğ, bir gazeteye verdiği demetçte 'Balyoz'da yer alan iddiaların 'ciddi' olduğunu söyledi. ZAMAN