Genelkurmay'ın iki yıldır üzerinde çalıştığı ve yakın dönemde hayata geçirmeyi planladığı 'tek tip askerlik' uygulaması tartışmaları da beraberinde getirdi. Devlet Bakanı ve Başmüzakereci Egemen Bağış, asıl çözümün tamamen profesyonel orduya geçmek olduğunu söylüyor. "Bir milyonluk amatör bir ordumuz olmasındansa daha az sayıda profesyonel bir ordu, değişen güvenlik şartlarında Türkiye için daha mantıklı." diyen Bağış, ilk aşamada bedelli askerliğin mutlaka gerektiğini vurguluyor. Kısa vadede özellikle Güneydoğu'da terörle mücadele kapsamında görev alacak askerlerin 18 yaşındaki çocukların toplam dört mermi kullanarak üç ayda aldıkları bir eğitim sonrasında hedef tahtası haline gelmelerini doğru bulmadığını vurgulayan Bakan Bağış, "Özellikle Güneydoğu'da terör bölgesinde çalışacak olan askerlerimizin bu konuda alınabilecek en iyi eğitimi almış, en iyi teçhizatla donatılmış ve bu işi bir meslek olarak görüp o formasyona sahip insanlardan oluşması gerekli." diye konuşuyor. Avrupa Birliği uygulamalarından örnekler veren Başmüzakereci, "Bugün AB üyesi 27 ülkenin sadece 7'sinde mecburi askerlik var. Onlarda da vicdanî ret var." hatırlatmasında bulunuyor. Bedelli askerlik seçeneğinin mutlaka hayata geçirilmesini isteyen Egemen Bağış, buradan elde edilecek kazancın profesyonel ordu için kullanılabileceğini söylüyor. Bağış, "Bedelli askerlik olması gerektiğine inanıyorum. İlk aşamada bedelli olmalı ama uzun vadede tamamen profesyonel bir orduya geçmeliyiz düşüncesindeyim." ifadelerini kullanıyor. Türkiye'de askerlik meselesinin toplumun tamamını memnun etmesi için önce bu terör belasının bitmesi gerektiğini anlatan Başmüzakereci Bağış, "Terör belasının bitmesi için de bizim bütün vatandaşlarımızı kucaklayan bir anayasaya ihtiyacımız var. Bütün vatandaşların, vatandaşı olmaktan onur duydukları bir devlet haline gelmemiz lazım." diyor.