Kurul, öğretim üyesi yetersiz fakültelere öğretim elemanı gönderilmesine olanak sağlayan kararın yürütmesinin durdurulmasına yapılan itirazı da reddetti. Türk Tabipleri Birliği YÖK'ün, 26 Şubat 2009 günlü ''öğretim üyelerinin rotasyonuna'' ilişkin kararının iptali ve yürütmesinin durdurulması istemiyle Danıştay'da dava açmıştı. Davayla ilgili ilk incelemesini yapan Danıştay 8. Dairesi, söz konusu kararının yürütmesini oy birliğiyle durdurmuştu. Davalı YÖK, bu karara itiraz ederek, kararın kaldırılmasını istedi. Danıştay İdari Dava Daireleri Kurulu, itirazı reddetti. Kurul ayrıca, kararın dayanağı 2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu'nun 41. maddesinin iptali istemiyle Anayasa Mahkemesi'ne başvurma kararı aldı. Danıştay 8. Dairesi, Yükseköğretim Yürütme Kurulu kararının iptal istemini daha sonra esastan görüşecek. Davalı YÖK'ün bu kararında, Abant İzzet Baysal, Afyon Kocatepe, Cumhuriyet, Dicle, Fırat, Gaziosmanpaşa, Harran, Kafkas, Kahramanmaraş Sütçü İmam, Mustafa Kemal, Yüzüncü Yıl ve Zonguldak Karaelmas üniversitelerine bağlı tıp fakültelerinin 261 anabilim dalı, bilim dalındaki öğretim üyesi ihtiyacının 2009-2010 öğretim yılı sonuna kadar ve en az 1 yıl süreyle, belirlenen 27 üniversiteye bağlı tıp fakültesinden 2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu'nun 41. maddesi uyarınca karşılanması öngörülüyordu.