Ergenekon'la, Danıştay'a yapılan hain saldırı arasındaki bağlantının netleşmesinden sonra, yasadışı yapılanmada panik yaşandığı öne sürüldü. Millete Komplo İddianamesi'nde, Ergenekon Davası sanıkları avukat Hüseyin Buzoğlu ile Ulusal Kanal Haber İstihbarat Şefi Ufuk Akkaya arasında geçen bir konuşma var. Konuşmanın gerçekleştiği tarih 16 Aralık 2008. Yani Yargıtay'ın "Danıştay Davası Ergenekon'la birleşsin" kararını açıkladığı gün... Saat 15.24'te gerçekleşen konuşmaya Buzoğlu başlıyor. Konuşmanın devamında, Akkaya, durumu, "işimiz çok zorlaştı" diye tarif ediyor. Bu konuşmaların, iddia edilen ETÖ yapılanmasındaki endişeyi anlattığı öne sürülüyor.