Dönemin İstanbul Valisi Erol Çakır, İstanbul Organize Şube Müdürü Adil Serdar Saçan, bazı DGM savcı ve hakimleri hakkında suç duyurusunda bulunacaklarını ifade eden Altun, yakınlarına İstanbul organize şubede işkence yapıldığını dile getirdi.28 Şubat dönemine ilişkin düşüncelerini anlatan Fermani Altun, geçmişte yaşanan darbelerde olduğu gibi 28 Şubat darbesinin de Türkiye'nin demokratik gelişmesine en büyük zararı verdiğini söyledi. 1997 yılında başlayan uygulamaların zulmünün on yıl boyunca devam ettiğini belirten Altun, "Halen de görev başında olan kalıntılar mevcuttur. Şahsım ve vakfımız bütün yapılan baskı, işkence ve yasaklara karşı yürekli bir duruş sergilemiştir. Darbeci derin güçlerin bizim ile ilgili aldıkları birçok karar ve uygulamalar belgeleri ile elimizdedir." ifadesini kullandı. 28 Şubat ve sonrası uygulamalarını yapan bazı kişiler hakkında suç duyurusunda bulunacaklarını belirten Altun açıklamasında şu ifadelere yer verdi: "Vakfımızı kapatmak için 6 yıl boyunca uğraştılar. Ekonomik yönden çökertmek için fabrikalarımı kapattılar, yakınlarıma İstanbul organize şubede işkence yaptılar. Kamuoyunda güya akıllarınca prestijimizi sarsmak için tuzaklar hatta öldürme planları yaptılar. Bu gafletin içinde İstanbul Valisi Erol Çakır, Organize Şube Müdürü Adil Serdar Saçan ve bazı DGM savcı ve hakimleri ile militerist derin güçler başta rol oynadılar. Bunlar hakkında suç duyurusunda bulunacağız. Neden bu kadar korkuyorlardı? Çünkü biz bütün farklılıkları bir araya getirerek kucaklaştırdık. Birlik ve kardeşliği sağladık. Zulüm kime yapılırsa mazlumun yanında yer almayı savunduk. 28 Şubat'ın hesabı sorulmalıdır, hem de en detayına köklerine kadar inilerek sorulmalıdır. AKP hükümetinden istediğimiz en önemli nokta bu hesaplaşmanın olmasıdır. Çünkü Sayın Başbakan da 28 Şubat mağduru idi. Onun uğradığı haksızlığın karşısında mücadele verdik hatta kendisini hapishanede ziyaret ettik. 28 Şubat ile ilgili mücadelemiz bir kitap olacak kadar yüklüdür. Çünkü o günlerde zulme karşı mücadele veren kişi ve kuruluş çok değildi, iki elin parmakları kadardı. Bütün darbeler halka ve demokrasiye yapılan ihanettir. Bu ihaneti yapanlar mutlaka cezasını görmelidirler."