Adı geçen generaller, YAŞ'ta terfi ettirilmedikleri için AYİM'e başvurmuş ve yürütmenin durdurulması kararını çıkarmıştı. Uzun süredir yargıda ikilik oluşturduğu eleştirilerine hedef olan AYİM'in kaldırılması önerileri gündeme gelmişti. Bakanların açığa alma kararını 'sivil darbe' olarak niteleyen CHP de, bu talebi dile getirenlerin başında yer almıştı. Genel Başkan Kemal Kılıçdaroğlu, referandum öncesinde AYİM'i kaldırma vaadinde bulunmuştu. AYİM'in kaldırılmasına yönelik, CHP'deki girişimler, Kılıçdaroğlu ile de sınırlı değil. Eski Genel Başkan Deniz Baykal da 1993 yılında TBMM'ye sunduğu anayasa değişikliği teklif taslağında, AYİM'in kaldırılmasını istemişti. Bu görüşleri unutan CHP'liler, bugün açığa alma kararı ve AYİM'i savunur noktaya geldi. Generallerin açığa alınmasından sonra dün konuşan CHP'li Kemal Anadol, "İntikam; bu da darbe, bu da sivil darbe." sözlerini sarf etti. Bugüne kadar YAŞ mağduru subayların başvurularını geri çeviren AYİM, Balyoz sanığı oldukları gerekçesiyle son şûra toplantısında bir üst rütbeye çıkarılmayan Tümgeneral Gürbüz Kaya, Tümgeneral Halil Helvacıoğlu ve Tuğamiral Abdullah Gavremoğlu'na terfi vermiş; sivil iradeyi yok saymıştı. İçişleri Bakanı Beşir Atalay ve Milli Savunma Bakanı Vecdi Gönül, Türkiye tarihinde ilk kez kanunların kendilerine tanıdığı hakkı kullandı ve devlet memuru konumundaki üç generali açığa aldı. Böylece AYİM'in kararı sonrasında Silahlı Kuvvetler'de oluşabilecek 'iki başlı komuta' görüntüsünün de yolu kapanmış oldu. Tartışmalı kararlara imza atan AYİM, varlığı konusunda da bir süredir çeşitli eleştirilere maruz kalıyor. CHP, uzun süredir Askerî Yüksek Mahkeme'nin kaldırılması gerektiğini savunuyor. CHP'nin bu konudaki ilk adımı 1993 yılında atılmıştı. Dönemin CHP Genel Başkanı Deniz Baykal, TBMM Anayasa Komisyonu'na sunduğu anayasa değişikliği teklif taslağında AYİM'i düzenleyen Anayasa'nın 157. maddesinin kaldırılmasını istedi. Baykal'ın önerisinde, "İdari yargıda bir ayrılık ve ayrıcalık kabul edilemez. Asker kişilerin özlük hakları ve idari işlemleri ile ilgili yargı denetimi için Danıştay yeterli ve uygun bir yargı kuruluşudur." görüşleri yer aldı. Geçen mayıs ayında Baykal'ın koltuğunu devralan CHP'nin yeni genel başkanı Kemal Kılıçdaroğlu da partisinin AYİM'le ilgili politikasını aynen sürdürdü. Kılıçdaroğlu, anayasa değişikliği tartışmaları sırasında sivillere askerî mahkeme yolunun kapanmasının yetersiz olduğuna işaret ederek, "Biz yargının sivilleşmesinden yanayız. Askerî Yüksek İdare Mahkemesi'nin kaldırılmasını ve davaların Danıştay'da görülmesini istiyoruz. Yani sivil mahkemelerde görülmesini istiyoruz. Çünkü biz özgür, sivil ve güçlü bir idare istiyoruz." ifadelerini kullandı.