Geçirdiği kalp krizi sonrasında hayatını kaybeden Ergenekon davası sanıklarından Aydın Engin'in cenaze namazı Ankara Kocatepe Camii'nde kılındı. Engin'in cenaze namazına CHP Genel Başkan Yardımcısı İzzet Çetin, CHP İstanbul Milletvekili Mustafa Özyürek, eski Adalet Bakanları Hikmet Sami Türk ve Seyfi Oktay, eski Yargıtay Başsavcısı Sabih Kanadoğlu, HSYK üyesi Suat Ertosun, Yargıtay 8. Ceza Dairesi Üyesi Hamdi Yaver Aktan, çok sayıda seveni ve ailesi katıldı. Aydın'ın eşi Naciye Aydın uzun süre tabut başında bekledi ve dua okudu. 10. ERGENEKON DALGASINDA GÖZALTINA ALINMIŞ Engin, Ergenekon davası kapsamında 7 Ocak 2009 tarihinde, eski YÖK Başkanı Kemal Gürüz, eski MGK Genel Sektreteri Tuncer Kılınç, eski Genelkurmay Adli Müşaviri Erdal Şenel, emekli Org. Kemal Yavuz, yazar Yalçın Küçük ve eski Özel Harekât Daire Başkanvekili İbrahim Şahin'in de bulunduğu 37 kişi ile birlikte gözaltına alınmış ve 11 Ocak 2009'da tutuklanarak cezaevine gönderilmişti. Ancak Aydın ile Yalçın Küçük'ün avukatlarının tutukluluğa yaptığı itiraz üzerine Aydın ve Küçük 11 gün tutuklu kaldıkları Silivri Cezaevi'nden tahliye edilmişti. Engin, Ergenekon soruşturması kapsamında hazırlanan 3. iddianamede de sanık olarak yer aldı. Aydın'ın "silahlı terör örgütüne üye olmak" suçundan 7.5 yıldan 15 yıla kadar hapsi isteniyordu. Aydın hala aynı dava kapsamında tutuksuz sanık olarak yargılanıyordu. Engin Aydın'ın iddianamede örgüt toplantısı olarak nitelendirilen 'Kent Otel' toplantılarının sekreterliğini yaptığı iddia ediliyordu. Bu toplantılara Hakimler ve Savcılar Yüksek Kurulu (HSYK) üyesi Ali Fuat Ertosun'un da 13 kez katıldığı iddia edilmişti. Aydın Engin'in cenazesi Karşıyaka mezarlığında toprağa verildi.