Olay, saat 19.30 sıralarında İpekyolu İlçesi Bostaniçi Mahallesi Vali Ali Cevdet Bey İlköğretim Okulu yakınında meydana geldi. Kapıköy'den 30 vagon ve yaklaşık 600 ton yükle Van'a gelmekte olan yük trenin geçişi sırasında PKK'lı teröristler tarafından raylara döşenen el yapımı patlayıcı uzaktan kumandayla patlatıldı. Ölen yada yaralananın olmadığı patlamada, lokomotifin camları ve farları kırıldı. Başka bir saldırı ihtimaline karşı tren Gar Müdürlüğü'ne hareket ederken, polis patlamayla ilgili soruşturma başlattı.